泛癌實體瘤靶向捕獲自動化方案
應用背景
高通量測序技術的應用日益廣泛，實驗室對于大規模、高效率、高穩定的實驗操作需求也越來越迫切。相比于人工操作，自動化工作站的方案在多個方面均有明顯優勢。納昂達開發了自動加樣系統 NadAuto-96，真正意義上實現“儀器+試劑+應用”的一站式自動化靶向捕獲方案。
方案推薦
樣品采用標準品 Human Genomic DNA Male；每個文庫的投入量為 50 ng gDNA。
自動化流程使用儀器內置應用，每批次構建 96 個文庫；捕獲時每樣本取 500 ng 捕獲前文庫進行單雜、4 雜、8 雜的實驗，每批次分別為 24、12 和 12 個捕獲反應。手動操作均按照產品說明書進行。
相關產品僅限研究使用，不用于臨床診斷。
圖 1. 自動化與手動文庫構建產出對比
圖 2. 自動化構建的文庫插入片段 注：96 個文庫中隨機選取 12 個文庫，使用 Qseq 進行檢測。
圖 3. 自動化不同批次間文庫構建產出差異
168 個自動化構建的 DNA 文庫，分別進行每批次 24 個單雜捕獲文庫，24 個混雜捕獲文庫（12 個 4 雜和 12 個 8 雜）實驗。
圖 4. 自動化構建雜交捕獲文庫相對產出
自動化平臺不同混雜方式構建的捕獲文庫的數據表現，如下：
圖 5. 自動化平臺不同混雜方式的捕獲表現
圖 6. 單雜插入片段大小和 GC 偏好性
圖 7. 4 雜插入片段大小和 GC 偏好性
圖 8. 8 雜插入片段大小和 GC 偏好性
