通用截短型雙端唯一接頭解決方案（MGI & Illumina）
應用背景
方案推薦
| 文庫構建 | 封阻序列 | 靶向捕獲 | 測序平臺 |
| NadPrep? DNA 通用型文庫構建試劑盒（for Illumina?）搭配 NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module | NadPrep? NanoBlockers (for Illumina?) |
NadPanel |
Illumina? Systems MGISEQ/DNBSEQ? |
四平衡設計優勢
圖 1. NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) 堿基平衡的設計優勢。NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module 設計為 4 Index 平衡：≥ 4 個連續 Index 文庫等比例混合測序時，Index 中各堿基即可滿足 MGI 平臺推薦的 ≥ 12.5% 比例。而 Illumina 平臺的一些設計方案 (如圖 I* UDI Adapter, P5 #1-12 Index)，即使多達 12 個連續 Index，仍無法滿足測序要求。
均一的數據產出
圖 2. NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) 的表現示例。A. 96 種 Index 類型文庫產量。50 ng 片段化 gDNA (Promega female, G1521)，按 NadPrep? DNA Library Preparation Kit (for Illumina?) 說明書操作，分別使用 1~96，擴增 5 個循環，平均文庫產出均 >1000 ng；B. 96 種 Index 類型文庫的數據有效拆分率。測序平臺：Illumina Novaseq 6000，PE150；MGISEQ-2000, PE150。
有效提升數據準確度
圖 3. NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) 文庫的串擾分析。96 個不同 Index 的 WGS 文庫混合后單條 lane 測序，測序模式：MGISEQ-2000， PE150。
注：綠色代表 perfectmatch 配對 barcode % ＞ 98.5%。
文庫產出穩定高效
圖 4. 搭配不同類型接頭的文庫產出。NadPrep? DNA Library Prepration Kit (for Illumina?) 分別搭配 NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 NadPrep? UDI Adapter Module (for Illumina?) 在不同 gDNA 起始量下的文庫產出。
注：樣本為人類女性基因組 DNA (Promega-Female, G1521)。
