NadPrep?? ES Hybrid Capture Reagents
#1005402
NadPrep? ES Hybrid Capture Reagents 是針對納昂達科技 NAD Panels/Probes 進行靶向捕獲快速雜交洗脫步驟優化的試劑盒， 以 NadPrep? NanoBlockers 系列和 120 nt NAD Panels/Probes 系列構成完整的液相雜交捕獲體系，支持針對不同大小 Panel 通過調 整雜交時間以優化捕獲性能，能夠在 0.5-4 hr 快速雜交或 16 hr 過夜雜交中靈活選擇。
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產品特色
● 精簡洗脫 Buffer 種類為 1 種，減少人為操作失誤的可能性；
● 簡化實驗流程，操作更便捷友好，利于自動化工作站開展；
● 支持在 0.5-4 hr 快速雜交或 16 hr 過夜雜交中靈活選擇；
● 支持調整雜交時間以優化捕獲性能；
產品表現
不同雜交時間的捕獲表現
注：捕獲 Panel 中 41.7 Mb 、2.6 Mb 和 0.23 Mb 分別為 NEXome Core Panel、NanOnco Plus Panel v2.0 和 LungCancer Panel v1.0。
不同大小 Panel 的捕獲表現
圖 2. NadPrep? ES Hybrid Capture Reagents 不同大小 Panel 雜交 2 hr 的捕獲表現。100 ng Human Genomic DNA (Promega, G1471)，使用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2，25℃ 片段化 25 min 進行預文庫構建；500 ng/預文庫投入，參照 NadPrep? ES Hybrid Capture Reagents 的雜交捕獲操作指南。 測序模式：DNBSEQ-T7，PE 150。選取適量數據用于后續分析，利用 BWA 比對 到參考基因組 hg38，On-target 按照 reads 數計算。A. 捕獲數據的中靶率和比對 率；B. 靶區域覆蓋度；C. Fold 80 base penalty 和重復率。
注：捕獲 Panel 中 3.27 Mb 、0.38 Mb 和 0.028 Mb 分別為 HiSNP Plus Panel v1.0、 NanOnCT Panel v1.0 和 NanoID Panel v1.0，其余同上。
不同測序平臺的捕獲表現
注：GC 偏好性僅以 2.6 Mb Panel 進行展示 。
多種變異分析
| 包裝編號 | 管/瓶蓋顏色 | 名稱 |
包裝體積 1005402 (16 rxn) |
包裝體積 1005401 (96 rxn) |
| Box 1 |
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ES Hyb #1 | 380 μL | 2×1150 μL |
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Hyb #2 | 120 μL | 720 μL | |
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Human Cot DNA | 110 μL | 650 μL | |
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ES Wash Buffer | 4×4 mL | 5×19 mL | |
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Sealing Oil | 250 μL | 1.5 mL | |
| Box 2 |
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Streptavidin Beads | 950 μL | 5.7 mL |
建議根據實際需求及 Panel 大小結合納昂達 Demo 數據綜合選擇。
② 雜交：包括雜交時間、Panel 大小、Blockers 封閉效果、雜交 Input 量、雜交摩爾量計算，PCR 儀溫度等；
③ 洗脫：洗脫的嚴謹度、試劑混勻程度、洗脫過程中的清洗力度等；
④ 擴增：擴增試劑的選擇、擴增引物與文庫類型是否一致，擴增的循環數等；
② 提前孵育熱洗脫部分 ES wash Buffer，不少于 15 min；
③ 捕獲磁珠 Streptavidin Beads 提前室溫平衡 30 min；
推薦使用溫控精準的 PCR 儀或金屬浴，如使用 Plate 操作模式，需要 PCR 儀為深孔，以確保洗脫溫度滿足說明書要求。
Sealing Oil 是一種礦物油，其本身不參與體系反應，只覆蓋在雜交體系液面上防止體系揮發。如果 PCR 儀熱蓋過緊有體系揮發風險或自動化操作及過夜雜交推薦加入 Sealing Oil，以保證數據的穩定性。
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產品 |
貨號 |
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NadPrep? ES Hybrid Capture Reagents, 16 rxn |
1005402 |
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NadPrep? ES Hybrid Capture Reagents, 96 rxn |
1005401 |
本產品僅限研究使用，不用于臨床診斷。
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