NadPrep?? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2
#1002602
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產品特色
● 適用于多類型樣本，包括：gDNA、FFPE B+/B/C/D 級 DNA 樣本
● DNA 片段化長度靈活可控
● 片段化、末端修復和加 A 一步完成，體系靈活、操作簡便
● 文庫產出穩定高效，覆蓋均一，低 GC 偏好性
● 低背景噪音（酶切副產物引入的異常序列）
● 兼容自動化工作站平臺
建庫流程
產品表現
文庫產出穩定高效
圖 1. NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 對不同起始量 gDNA 樣本的建庫產出。NadPrep? EZ DNA Library Preparation Module v2 (NadPrep? Enfrag v2) 分別搭配 A. NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 NadPrep? UDI Adapter Module (for Illumina?) 和 B. NadPrep? Universal Adapter (SI) Module (for MGI) 和 NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 構建文庫，酶切 25 min，文庫擴增參考推薦循環數。
兼容不同類型樣本
圖 2. NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 對不同類型樣本的建庫產出。NadPrep? EZ DNA Library Preparation Module v2 分別搭配 A. NadPrep? UDI Adapter Module (for Illumina?) 和 B. NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 構建文庫，酶切時間和擴增循環數文庫擴增參考相應說明書。
注：樣本分級標準 | gDNA：~ 15 kb 有明亮單一不拖尾條帶；FFPE B+：~ 15 kb 有主帶，存在輕微彌散，主帶比彌散狀帶明顯；FFPE B：~ 15 kb 有隱約可見主帶，同時存在中度彌散；FFPE C：條帶主要分布在 200-2500 bp，呈彌散狀；FFPE D：條帶主要分布在 250-1000 bp，呈彌散狀。
片段化長度靈活可控
圖 3. 不同類型樣本在不同酶切條件下的文庫片段分布。A. 250 ng gDNA 樣本為起始量，利用 NadPrep? EZ DNA Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep? UDI Adapter Module (for Illumina?) 構建文庫，參照說明書，酶切不同時間，以獲得不同長度 DNA 片段；B. 50 ng 不同等級的 FFPE DNA 樣本為起始量構建文庫，參照說明書，酶切不同時間，以獲得 250 bp DNA 片段。
低 GC 偏好性
圖 4. NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 對宏基因組樣本的建庫表現。微生物群組 DNA 標準品 (Zymo Research, D6306）經不同文庫制備方案比較微生物的檢測情況，NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 的 GC 偏好性跟超聲片段化文庫構建試劑盒相比無明顯差異。
注：NadPrep? Sonication: NadPrep? DNA 通用型文庫構建模塊 (for Illumina?)； NadPrep? Enfrag v2: NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建模塊 v2 ，均搭配 NadPrep? UDI Adapter Module (for Illumina?)。
引入背景噪音較低
圖 5. 不同類型樣本經不同文庫構建試劑盒建庫時文庫產出中異常 reads 的占比。gDNA 及不同等級的 FFPE DNA 樣本以 50 ng 為起始量，分別采用 NadPrep? Sonication: NadPrep? DNA 通用型文庫構建模塊 (for Illumina?) 、NadPrep? Enfrag v2: NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建模塊 v2、Vendor Q *、 Vendor K* 和 Vendor V* 酶切片段化文庫構建試劑盒建庫，500 ng 同一建庫方案的文庫雜交，并通過 NanOnco Plus Panel v2.0 完成捕獲，按照 total reads 計算。A. gDNA 樣本經不同文庫構建方案建庫的文庫產出及文庫中異常 reads 占比 (Illumina 平臺)；B. 不同等級 FFPE DNA 樣本經酶切片段化文庫構建試劑盒建庫時文庫產出中異常 reads 占比 (MGI 平臺)。
注：Artifact rate: 酶切副產物引入的異常序列占比。
優異的靶向捕獲表現
圖 6. 酶切和超聲片段化構建文庫的捕獲表現。50 ng 不同等級的 FFPE DNA 樣本分別進行酶切和超聲片段化建庫，500 ng 同一建庫方案的文庫雜交，并以 NanOnco Plus Panel v2.0 (2.6 M) 搭配 NadPrep? Hybrid Capture Reagents 和 NadPrep? NanoBlockers (for Illumina?) 組成完整的雜交捕獲方案，測序數據取 2 M reads pair 分析，不同建庫方案的文庫捕獲數據在 A. 比對率和中靶率方面的表現基本保持一致，但在 B. Fold 80 penalty，C. Duplication rate (重復率) 和 D. Mate on differ chr (自連率) 方面的表現均優于競品。
文庫構建模塊
| 包裝編號 | 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1002601(24 rxn) |
包裝體積 1002602 (96 rxn) |
| Box1 |
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FERA Buffer | 150 μL | 575 μL |
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FERA Enzyme | 150 μL | 575 μL | |
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Enhancer Buffer | 250 μL | 950 μL | |
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Ligation Buffer | 750 μL | 2×1500 μL | |
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DNA Ligase | 60 μL | 230 μL | |
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2X HiFi PCR Master Mix | 720 μL | 2×1600 μL | |
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/ |
Nuclease Free Water | 2.5 mL | 8 mL | |
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TE Solution | 1 mL | 4 mL | |
| Box2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 4 mL | 15 mL |
單端接頭模塊 (for MGI)
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003611 (24 rxn) |
包裝體積 1003621 (96 rxn) |
包裝體積 1003622(96 rxn) |
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NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 12×15 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) |
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NadPrep M-Adapter (SI) | 60 μL (Tube) | 230 μL (Tube) | 230 μL (Tube) |
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003641 (96 rxn) |
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NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 96×8 μL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (SI) | 260 μL (Tube) |
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NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, SI) | 75 μL (Tube) |
雙端唯一接頭模塊 (for MGI)
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003711 (24 rxn) |
包裝體積 1003721 (96 rxn) |
包裝體積 1003722 (96 rxn) |
包裝體積 1003725 (96 rxn) |
包裝體積 1003726 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 12×15 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 60 μL (Tube) | 230 μL (Tube) | 230 μL (Tube) | 230 μL (Tube) | 230 μL (Tube) |
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003751 (96 rxn) |
包裝體積 1003752 (96 rxn) |
包裝體積 1003753 (96 rxn) |
包裝體積 1003754 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) |
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|
NadPrep M-Adapter (DI) | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) |
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003761 (1152 rxn) |
包裝體積 1003762 (1152 rxn) |
包裝體積 1003763 (1152 rxn) |
包裝體積 1003764 (1152 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) |
通用截短型雙端唯一接頭模塊
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003240 (24 rxn) |
包裝體積 1003241 (96 rxn) |
包裝體積 1003242 (96 rxn) |
|
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 12×15 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) | 24×25 μL (Tube) |
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|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 60 μL (Tube) | 230 μL (Tube) | 230 μL (Tube) |
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|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 20 μL (Tube) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) |
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003251 (96 rxn) |
包裝體積
1003252 (96 rxn) |
包裝體積
1003253 (96 rxn) |
包裝體積
1003254 (96 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) | 96×8 μL (Plate) |
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|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) | 260 μL (Tube) |
|
|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) | 75 μL (Tube) |
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003261 (1152 rxn) |
包裝體積
1003262 (1152 rxn) |
包裝體積
1003263 (1152 rxn) |
包裝體積
1003264 (1152 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) | 96×72 μL (Tube) |
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|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) | 2×1350 μL (Tube) |
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|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) | 900 μL (Tube) |
全長型雙端唯一接頭模塊（for Illumina）
| 管蓋顏色 | 組分名稱 |
包裝體積 1003211 (24 rxn) |
包裝體積 1003222 (24 rxn) |
包裝體積 1003211 (96 rxn) |
包裝體積 1003212 (96 rxn) |
包裝體積 1003213 (192 rxn) |
包裝體積 1003224* (480 rxn) |
|
|
NadPrep UDI Adapter # | 12×10 μL (Tube) | 12×10 μL (Tube) | 12×22 μL (Tube) | 12×22 μL (Tube) | 24×22 μL (Tube) | 96×3.5 μL (Plate)×5 |
| 類別 | 產品 | 詳情 | 貨號 |
| 建庫模塊 | NadPrep? EZ DNA Library Preparation Module v2, 24 rxn | 24 rxn | 1002601 |
| NadPrep? EZ DNA Library Preparation Module v2, 96 rxn | 96 rxn | 1002602 | |
| 截短型單端接頭模塊 | NadPrep? Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | SI 1-12 | 1003611 |
| NadPrep? Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | SI 1-96 |
1003641 |
|
| NadPrep? Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | SI 1-24 | 1003621 | |
| NadPrep? Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | SI 25-48 | 1003622 | |
| 截短型雙端唯一接頭模塊 | NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | MDI 1-12 | 1003711 |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-24 | 1003721 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | MDI 25-48 | 1003722 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn | MDI 49-72 | 1003725 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn | MDI 73-96 | 1003726 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-96 | 1003751 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn | MDI 97-192 | 1003752 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn | MDI 193-288 | 1003753 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn | MDI 289-384 | 1003754 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn | MDI 1-96 | 1003761 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn | MDI 97-192 | 1003762 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn | MDI 193-288 | 1003763 | |
| NadPrep? Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn | MDI 289-384 | 1003764 | |
| 通用截短型雙端唯一接頭模塊 | NadPrep? Universal Syubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn | Index 1-12 | 1003240 |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn | Index 1-24 | 1003241 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn | Index 25-48 | 1003242 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn | Index 1-96 | 1003251 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn | Index 97-192 | 1003252 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn | Index 193-288 | 1003253 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn | Index 289-384 | 1003254 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn | Index 1-96 | 1003261 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn | Index 97-192 | 1003262 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn | Index 193-288 | 1003263 | |
| NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn | Index 289-384 | 1003264 | |
| 全長型雙端唯一接頭模塊 | NadPrep? UDI Adapter Kit Set A (for Illumina?), 96 rxn |
Index
1-12 300 pmol / 接頭 |
1003211 |
| NadPrep? UDI Adapter Kit Set B (for Illumina?), 96 rxn |
Index
13-24 300 pmol / 接頭 |
1003212 | |
| NadPrep? UDI Adapter Kit Set A&B (for Illumina?), 192 rxn |
Index
1-24 300 pmol / 接頭 |
1003213 | |
| NadPrep? UDI Adapter Kit Set C1 (for Illumina?), 24 rxn |
Index
1-12 24 rxn |
1003221 | |
| NadPrep? UDI Adapter Kit Set D1 (for Illumina?), 480 rxn |
Index
1-96 480 rxn |
1003224 |
產品資料
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NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2
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文庫構建模塊和接頭模塊參考指南 (for MGI)
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文庫構建模塊和接頭模塊參考指南 (for Illumina?)
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MDI Index Sequence
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Universal Stubby Adapter (UDI) Index Sequence
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UDI Adapter & Index Sequence
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NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 使用說明書 (for MGI)
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NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 使用說明書 (for Illumina?)
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