捕獲表現
圖 1. HLAtyping Panel v2.0 的捕獲表現。利用 HLAtyping Panel v2.0 分別對標準品進行靶向富集后,通過 Illumina? 平臺進行測序。
注:標準品為 Class I 和 Class II UCLA DNA Reference Panel。HLAtyping Panel v2.0 的捕獲表現由 24 種 Class I 和 24 種 Class II 計算平均值及標準偏差。
分型表現
表 1. HLAtyping Panel v2.0 對 Class I 的分型結果。
50 ng gDNA 利用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 建庫,以 HLAtyping Panel v2.0 完成雜交捕獲 (6 plex),Novaseq 6000 PE150 測序,數據量 ~ 0.5 Gb。測序結果以內部工具進行 HLA 分型。
注:標準品為 Class I UCLA DNA Reference Panel。每個標準品第一排為標準品提供的分型結果,第二排為 HLAtyping Panel v2.0 數據分型結果。
圖 2. C1-213 以 HLAtyping Panel v2.0 捕獲測序,測序數據比對回分型結果顯示的型別的參考序列上,不允許錯配的條件下對參考序列的覆蓋情況。HLAtyping Panel v2.0 對 Class I 的分型結果中出現個別在第二數段上存在差異的結果,經過序列比對和檢驗發現,HLAtyping Panel v2.0 的新的分型結果更符合:在不允許錯配比對的條件下,整條參考序列連續覆蓋; 而舊的結果則出現覆蓋的中斷,即此處的序列組成缺乏支持。
注:C*08:02 (上) 為標準品 C1-213 提供的分型結果,覆蓋不連續;C*08:01 (中) 為新的分型結果,覆蓋連續;同時顯示結果一致的另一個等位基因 C*12:02 的覆蓋情況 (下)。
貨號 |
管蓋
顏色 |
產品名稱 |
包裝
體積 |
包裝/儲存溫度 |
1001951 |
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HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
1001952 |
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HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
本產品僅限研究使用,不用于臨床診斷。
產品名稱(英文)
產品名稱(中文)
貨號
HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn
白細胞抗原分型檢測組套 v2.0,16 反應
1001952
HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn
白細胞抗原分型檢測組套 v2.0,96 反應
1001951
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