NanOnco Plus Panel v3.0
#1001111F (96 rxn)
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產品表現
捕獲表現
圖 1. NanOnco Plus Panel v3.0 對不同 gDNA 文庫的捕獲表現。利用 NadPrep?快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒搭配 NadPrep? UDI Adapter (for Illumina?) 構建文庫，測序模式為 Illumina Novaseq 6000，PE150，利用 BWA 比對到參考基因組 hg38，按照 reads 數計算。A. 捕獲數據比對率和捕獲效率；B. 靶區域覆蓋度；C. 覆蓋均一性和一致性。
注：樣本 gDNA_1-4 分別為：人類男性基因組 DNA (Promega-male, G1471)；腫瘤結構變異 5% gDNA 標準品 (菁良，GW-OGTM001)；腫瘤 SNV 1-25% gDNA 標準品(菁良，GW-OGTM004)；腫瘤 SNV 野生型 gDNA 標準品 (菁良，GW-OGTM005)。
多種變異分析
圖2. NanOnco Plus Panel v3.0 捕獲數據中變異頻率與標準品標稱頻率的一致性展示。利用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒搭配 NadPrep? Universal Stubby Adapter (UDI) 構建文庫，測序模式為 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict 進行變異分析。
注：樣本為 Onco Multiplex gDNA (LDTBIO，定制標準品)，平均測序深度 3518x。
表 1. NanOnco Plus Panel v3.0 對其他變異類型檢測。
利用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒搭配 NadPrep? UDI Adapter (for Illumina?) 構建文庫，測序模式為 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict、Delly、CNVkit 分別進行變異分析。GW-OGTM001 的平均測序深度 966.71x，GW-OGTM005 的平均測序深度 1126.04x。
注：樣本為腫瘤結構變異 5% gDNA 標準品 (菁良，GW-OGTM001) ，對照為腫瘤 SNV 野生型 gDNA 標準品 (菁良，GW-OGTM005)。
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貨號 |
管蓋 顏色 |
產品名稱 |
包裝 體積 |
包裝/儲存溫度 |
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1001112F |
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NanOnco Plus Panel v3.0, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
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1001111F |
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NanOnco Plus Panel v3.0, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
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產品 |
貨號 |
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NanOnco Plus Panel v3.0, 16 rxn |
1001112F |
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NanOnco Plus Panel v3.0, 96 rxn |
1001111F |
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應用指南
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