基因列表及覆蓋區域信息 |
|||||||||||
ABL1*? |
ABL2 |
AKT3 |
ALK |
ARHGAP26 |
AXL |
BCL2? |
BCOR* |
BRAF |
BRD3* |
BRD4* |
CAMTA1 |
CCNB3* |
CCND1 |
CIC? |
COL6A3 |
CSF1R |
DNAJB1 |
EGFR |
EML4 |
EPC1* |
ERBB2? |
ERG* |
ESR1 |
ETS1 |
ETV1* |
ETV4 |
ETV5* |
ETV6* |
EWSR1 |
FGFR1 |
FGFR2 |
FGFR3 |
FGR* |
FLI1 |
FLT3 |
FOSB |
FOXO1 |
FUS |
GLI1 |
HMGA2 |
INSR |
JAK2* |
JAK3 |
JAZF1 |
KIF5B? |
KIT? |
KMT2A |
MAML2 |
MAST1 |
MAST2 |
MEAF6 |
MET* |
MLLT3 |
MSH2 |
MSMB? |
MUSK |
MYB |
MYC |
NCOA1* |
NCOA2* |
NOTCH1 |
NOTCH2 |
NOTCH3? |
NR4A3* |
NRG1 |
NTRK1 |
NTRK2 |
NTRK3 |
NUMBL |
NUTM1 |
PAX3 |
PAX7 |
PDGFB |
PDGFRA |
PDGFRB? |
PHF1* |
PIK3CA* |
PKN1 |
PLAG1* |
PPARG* |
PRKACA |
PRKCA |
PRKCB |
RAF1 |
RARA* |
RELA |
RET |
ROS1 |
RSPO2* |
RSPO3 |
SS18 |
STAT6* |
TAF15 |
TCF12? |
TCF3 |
TERT |
TFE3 |
TFEB |
TFG |
THADA |
TMPRSS2*? |
TP53* |
USP6* |
YWHAE* |
* 覆蓋全部 5'-UTR;?覆蓋全部 3'-UTR。
產品表現
捕獲表現
圖 1. OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 的捕獲表現。A. 典型的捕獲測序數據組成,B. 捕獲測序與RNAseq數據靶基因相對豐度的比較。 Human Brain Total RNA 標準品 (HBR,Clontech,貨號:636530) 利用 NadPrep? Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep? DNA 通用型文庫構建試劑盒系列建庫,分別進行:直接測序 (RNAseq),或 RNA 捕獲測序 (OncoFu E)。
融合檢測示例
圖 2.OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 應用于 FFPE 融合 RNA 參考品的基因融合分析示例。A. OncoFu E 靶向富集與 RNAseq 的比較;B. 參考品倍數稀釋后OncoFu E 的靶向富集表現。100 ng Seraseq? FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material利用 NadPrep? Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep? DNA 通用型文庫構建試劑盒系列建庫,分別進行:直接測序 (RNAseq),去除 rRNA 測序 (rRNA-depleted RNAseq,NEBNext rRNA Depletion Kit v2) 和 RNA 捕獲測序 (OncoFu E),并取 1 Gb 數據量進行融合分析 (FusionCatcher v1.10)。
貨號 |
管蓋
顏色 |
產品名稱 |
包裝
體積 |
包裝/儲存溫度 |
1001512 |
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OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn |
70 μL |
-20℃ |
1001511 |
|
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn |
415 μL |
-20℃ |
1001513 |
|
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn |
415 μL × 5 |
-20℃ |
1、Intron 區 repeats 無法放置探針;
2、Intron 區跨度巨大,需放置大量探針;
產品 |
貨號 |
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn |
1001512 |
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn |
1001511 |
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn |
1001513 |
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