NEXome Plus Panel v1.0
#1001861
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- 全基因組 SNP 骨架
- 實體瘤相關融合區域
包含常見融合相關的內含子區域和非編碼區域，可用于分析實體瘤中的融合位點。
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ALK intron 18 - 19 |
BCL2 3'UTR |
BCR intron 8, 13 - 14 |
BRAF intron 7 - 10 |
BRCA1 intron 2, 7 - 8, 12, 16, 19 - 20 |
BRCA2 intron 2 |
CD74 intron 6 - 8 |
EGFR intron 7, 15, 24 - 27 |
ETV4 intron 5 - 6 |
ETV5 intron 6 - 7 |
ETV6 intron 5 - 6 |
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EWSR1 intron 6 - 13 |
EZR intron 9 - 12 |
FGFR1 intron 1, 5, 17 |
FGFR2 intron 1, 17 |
FGFR3 intron 17 |
FLI1 intron 3 - 8 |
KIT intron 16 |
KMT2A intron 6 - 11 |
MET intron 1, 14 |
MSH2 intron 5 |
MYB intron 14 |
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MYC intron 1 |
NOTCH2 intron 26 |
NTRK1 intron 8 - 10 |
NTRK2 intron 12, 15 |
NTRK3 intron 13 - 14 |
NUTM1 intron 1 |
PDGFB intron 1 |
PDGFRA intron 7, 9, 11 |
RAF1 intron 4 - 9 |
RARA intron 2 |
RET intron 7 - 11 |
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ROS1 intron 31 - 35 |
RSPO2 Upstream, 5'UTR, exon 1 - 2, intron 1 |
SDC4 intron 2 |
SLC34A2 intron 4 |
TMPRSS2 intron 1 - 3 |
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- 經典微衛星位點
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BAT-25 |
BAT-26 |
BAT-40 |
BAT-RII |
NR-21 |
NR-22 |
NR-24 |
NR-27 |
MONO-27 |
D2S123 |
D5S346 |
D17S261 |
D17S520 |
D17S250 |
D18S34 |
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產品表現
捕獲表現
圖 1. NEXome Plus Panel v1.0 在單雜和 12 雜情況下的捕獲表現。利用 NadPrep? DNA 通用型文庫構建試劑盒 (for Illumina?) 構建文庫，以 NEXome Plus Panel v1.0 完成雜交捕獲，測序模式為 Illumina HiSeq X Ten，PE150，利用 BWA 比對到參考基因組 hg38，on-target 按照 reads 數計算。
注：樣本為：人類男性基因組 DNA (Promega-Male, G1471) 和人類女性基因組 DNA (Promega-Female, G1521) 。
圖 2. NEXome Plus Panel v1.0 對不同 gDNA 文庫的捕獲表現。利用 NadPrep? DNA 通用型文庫構建試劑盒 (for Illumina?) 構建文庫，以 NEXome Plus Panel v1.0 (12 plex) 完成雜交捕獲，測序模式為 Illumina HiSeq X Ten，PE150，利用 BWA 比對到參考基因組 hg38，on-target 按照 reads 數計算。 A. 捕獲數據比對率和捕獲效率；B. 靶區域覆蓋度；C. 覆蓋均一性和一致性；D. GC 偏好性。
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貨號 |
管蓋
顏色 |
產品名稱 |
包裝
體積 |
包裝/儲存溫度 |
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1001861 |
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NEXome Plus Panel v1.0, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
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1001862 |
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NEXome Plus Panel v1.0, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
| 產品 | 貨號 |
| NEXome Plus Panel v1.0, 16 rxn | 1001862 |
| NEXome Plus Panel v1.0, 96 rxn | 1001861 |
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