μCaler? HotSpot Panel v1.0 靶向腫瘤突變“熱點”區域,涉及致癌和腫瘤抑制相關的 49 個熱點突變基因,探針覆蓋基因組約 25 Kb 區域。
該 Panel 與 μCaler? Hybrid Capture System 配套使用?;谌碌?μCaler? 靶向富集系統, μCaler? HotSpot Panel v1.0 提升了捕 獲效率,捕獲表現穩定優異且大幅度減少了實驗所需時間,實現更高效的測序并節省成本。
AKT1 | ALK | APC | AR | ARAF | ATM | BRAF | CDKN2A | CHEK2 | CTNNB1 |
DDR2 | EGFR | ERBB2 | ERBB3 | ESR1 | FBXW7 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FGFR4 |
FLT3 | GNA11 | GNAQ | GNAS | HRAS | IDH1 | IDH2 | KIT | KRAS | MAP2K1 |
MAP2K2 | MET | MTOR | NRAS | NTRK1 | NTRK3 | PDGFRA | PIK3CA | PTCH1 | PTEN |
RAF1 | RET | ROS1 | SF3B1 | SMAD4 | SMO | STK11 | TP53 | TSC1 |
捕獲表現
圖 1. μCaler? HotSpot Panel v1.0 的捕獲表現。100 ng 人類男性基因 DNA 標準品 (Promega,G1471) 和 OncoOne 泛腫瘤 gDNA 標準品 (LDT Bioscience, LDT900) ,利用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 進行預文庫構建。 500 ng/預文庫投入,參照 μCaler? 雜交捕獲指南。利用 BWA 比對到參考基因組 hg38,On-target 按照 reads 數計算。A. 捕獲數據的中靶率、比對率及靶區域覆蓋度;B. 靶區域覆蓋均一性。
注:測序模式為 Illumina Novaseq 6000,PE150。
變異分析
圖 2. μCaler? HotSpot Panel v1.0 捕獲數據中變異頻率與標準品頻率的一致性。利用 NadPrep? 快速 DNA 酶切文庫構建試劑盒 v2 構建預文庫,以 μCaler? HotSpot
Panel v1.0 完成雜交捕獲,Vardict
1.5.1 進行變異分析。測序模式:Illumina
Novaseq 6000,PE150。
注:樣本為人類男性基因組 DNA 標準品 (Promega,G1471) 和 OncoOne 泛腫瘤 gDNA 標準品 (LDT
Bioscience,LDT900)
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貨號 |
管蓋 顏色 |
產品名稱 |
包裝 體積 |
包裝/儲存溫度 |
1101402 |
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μCaler? HotSpot Panel v1.0, 16 rxn |
40 μL |
-20℃ |
1101401 |
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μCaler? HotSpot Panel v1.0, 96 rxn |
210 μL |
-20℃ |
產品 |
貨號 |
μCaler? HotSpot Panel v1.0, 16 rxn |
1101402 |
μCaler? HotSpot Panel v1.0, 96 rxn |
1101401 |
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